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Thèses en cours


BASSIGNANI Ariane .
Intégration et analyse de données de métaprotéomique quantitative en shotgun pour explorer les fonctionnalités du microbiote intestinal humain dans le cadre des maladies cardiométaboliques ED 394 (Physiologie Physiopathologie et Thérapeutique UPMC Sorbonne Universités) Début thèse : 01/2017
Directeur de thèse : C. Juste (INRA, MICALIS)
Encadrant(s) : S. Plancade (INRA, MaIAGE), M. Berland (INRA, MGP) - Equipe(s): StatInfOmics

BAUDIER Claire.
Décoder les mécanismes moléculaires sous-jacents à l'allocation dynamique des ressources chez la bactérie par une approche couplant modélisation et expérimentation. Structure et dynamique des systèmes vivants. Début thèse : 10/2014
Directeur de thèse : V. Fromion (MaIAGE)
Encadrant(s) : Philippe Robert - Equipe(s): BioSys

COLAS Floriane.
Développement d'un modèle d'aide à la décision pour la gestion intégrée de la flore adventice. Méta-modélisation et analyse de sensibilité d'un modèle mécaniste complexe (FLORSYS) des effets des systèmes de culture sur la dynamique de la flore adventice ED Bourgogne-Franche-Comté Début thèse : 10/2014
Directeur de thèse : Colbach (INRA / EA - Dijon)
Encadrant(s) : Colbach (INRA / EA -Dijon), J.P. Gauchi (INRA / MaIAGE) , Villerd (INRA / Nancy) - Equipe(s): Dynenvie

Darrigade Léo.
Modélisation du dialogue hôte-microbiote au voisinage de l’épithélium de l’intestin distal EDMH Début thèse : 11/2017
Directeur de thèse : B. Laroche
Encadrant(s) : B. Laroche (MaIAGE), S. Labarthe (MaIAGE), C. Cherbuy (MICALIS), M. Thomas (MICALIS) - Equipe(s): Dynenvie

DESLANDES François.
Modélisation de la biogénèse des oléosomes chez Arabidopsis thaliana ED435 ABIES Début thèse : 10/2014
Directeur de thèse : B. Laroche (MaIAGE, INRA Jouy-en-Josas)
Encadrant(s) : A. Trubuil (MaIAGE, INRA Jouy-en-Josas) - Equipe(s): Dynenvie / BioSys

DIOP Ousmane.
Analyse mathématique de la dynamique de réseaux de régulation biologique ED STIC Université Paris-Saclay Début thèse : 10/2017
Directeur de thèse : V. Fromion (MaIAGE, INRA Jouy en Josas)
Encadrant(s) : L. Tournier (MaIAGE, INRA Jouy en Josas) - Equipe(s): BioSys

FERRE Arnaud.
Acquisition automatique de connaissances à partir d’articles scientifiques pour la modélisation du développement de la graine chez Arabidopsis thaliana ED STIC Début thèse : 10/2015
Directeur de thèse : C. Nédellec (Inra), P. Zweigenbaum (CNRS)
- Equipe(s): Bibliome

GARNAULT Maxime.
Composantes du risque de résistance aux fongicides anti-septoriose chez Zymoseptoria tritici et identification de stratégies anti-résistance durables. ABIES (AgroParisTech) Début thèse : 11/2016
Directeur de thèse : Olivier David (MaIAGE, INRA)
Encadrant(s) : Christian Lannou (INRA), Anne-Sophie Walker (INRA Grignon), Florence Carpentier (INRA Grignon), Olivier David (INRA) - Equipe(s): Dynenvie

JEANNE Guillaume.
Optimisation de la conception de bioprocédés : vers une approche intégrée biologie de synthèse et conduite du procédé. ED STIC Université Paris Saclay Début thèse : 10/2015
Directeur de thèse : V. Fromion (MaIAGE, INRA Jouy en Josas)
Encadrant(s) : A. Goelzer (MaIAGE, INRA Jouy en Josas) - Equipe(s): BioSys

KAMARI Halaleh.
"Qualité prédictive de méta-modèles construits sur des espaces RKHS et analyse de sensibilité de modèles complexes. Prédiction de la transition du métabolisme de la feuille du maïs." ED574 EDMH Début thèse : 10/2016
Directeur de thèse : ML. Taupin (UMR statistique et Génome, U. Evry)
Encadrant(s) : S. Huet (MaIAGE, INRA Jouy en Josas), ML. Taupin (UMR statistique et Génome, U. Evry) - Equipe(s): StatInfOmics

KCHOUK Mehdi.
Pas encore déterminé Ecole doctorale de Mathématiques, Informatique, Sciences et Technologies de la Matière (MISTM), Université Tunis El-Manar (Tunisie) Début thèse : 10/2014
Directeur de thèse : M. Elloumi
Encadrant(s) : J-F Gibrat - Equipe(s): StatInfOmics

Lu Yunjiao.
Dynamiques intracellulaires et imagerie de super-résolution : la paroi bactérienne sondée à l'échelle moléculaire MathSTIC Début thèse : 10/2017
Directeur de thèse : Charles Kervrann
Encadrant(s) : Charles Kervrann, Alain Trubuil, Rut Carballido-Lopez - Equipe(s): BioSys

MONTAGNON Pierre.
Dynamiques de populations et propagation d'épidémies sur des graphes dynamiques ED574 EDMH Début thèse : 10/2016
Directeur de thèse : Vincent Bansaye (Ecole Polytechnique : CMAP)
Encadrant(s) : Vincent Bansaye (Ecole Polytechnique : CMAP), Elisabeta Vergu (INRA, MaIAGE) - Equipe(s): Dynenvie

MOULIN Cécile.
"Analyse des voies métaboliques au cours du cycle cellulaire: application au métabolisme du cancer" ED STIC Université Paris Saclay Début thèse : 10/2016
Directeur de thèse : S. Peres (LRI, Université Paris Saclay)
Encadrant(s) : L. Tournier (MaIAGE, INRA Jouy en Josas) - Equipe(s): BioSys

OODALLY Ajmal.
Estimation dans les modèles de fragilité à corrélations spatiales à partir d'une vraisemblance partielle pour analyser la propagation de la malaria en Ethiopie EDMH Début thèse : 10/2017
Directeur de thèse : KUHN Estelle
Encadrant(s) : KUHN Estelle, DUCHATEAU Luc - Equipe(s): Dynenvie

SULTAN Ibrahim.
Transcriptional regulatory network reconstruction from sequence and expression data Ecole Doctorale SDSV (Structure et Dynamique des Systèmes Vivants) de l'Université Paris-Saclay. Début thèse : 10/2015
Directeur de thèse : S. Schbath (MaIAGE, INRA Jouy en Josas)
Encadrant(s) : P. Nicolas (MaIAGE, INRA Jouy en Josas) - Equipe(s): StatInfOmics

VILA NOVA Meryl.
Méthode automatique de typage bactérien par pangénome et variants alléliques à partir de séquençage à haut débit ABIES Début thèse : 10/2016
Directeur de thèse : M.-Y. Mistou (Anses)
Encadrant(s) : N. Radomski (Anses), M. Mariadassou (INRA) - Equipe(s): StatInfOmics

ZAAROUR Marwa.
Analysis and rerouting of cellular resources for improvement of heterologous protein production in Bacillus subtilis. ED SVDV Début thèse : 09/2015
Directeur de thèse : V. Sauveplane (MICALIS, INRA Jouy)
Encadrant(s) : V. Fromion, A. Goelze (MaIAGE, INRA Jouy), M. Jules (MICALIS, INRA Jouy) - Equipe(s): BioSys


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by Dr. Radut