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Chairs and leads


Scientifics events organised by the unit and leads animated by the unit

Evènement(s) scientifique(s)


BioNLP-ST :
BioNLP Shared Task (2011-2016)

BioNLP Shared Task is a series of Shared Task in Information Extraction from text in Biology. We contribute to the general organisation and to the organization of specific tasks on gene regulation in bacteria (LLL, BI, GRN) and plant (GRNA) and bacteria habitats (Bacteria Biotope tasks). More details can be found at the dedicated web sites in 2011, 2013 and 2016 and in the papers of the ACL BioNLP workshop proceedings in 2011 (Portland, USA), 2013 (Sofia, Bulgaria) and 2016 (Berlin, Germany).


EC Ecologie Microbienne :
École Chercheurs Écologie Microbienne (14-17 juin 2016) Pont-à-Mousson
Member(s) of the relevant unity for the animation : Béatrice Laroche, Mahendra Mariadassou

Les objectifs de l'École-Chercheurs sont de (1) s’approprier les concepts d’écologie et plus particulièrement d’écologie microbienne et les partager grâce à un vocabulaire commun, (2) d'optimiser l’exploitation des données massives hétérogènes et proposer des approches d’analyse génériques et enfin (3) stimuler l’émergence de nouveaux projets transdisciplinaires.


RCAM'16 :
Recent Computational Advances in Metagenomics (4 septembre 2016) The hague, Netherlands
Member(s) of the relevant unity for the animation : Valentin Loux, Mahendra Mariadassou, Sophie Schbath

Web site : http://maiage.jouy.inra.fr/?q=fr/rcam2016

This workshop aims at promoting discussions and collaborations between biologists (modelers), computer scientists and applied-mathematicians involved in metagenomics and/or metatranscriptomics studies, either in the bioinformatics or statistical aspects of such analysis.


SMPGD 2016 :
Statistical Methods for Post-Genomic Data. (11-12 février 2016) Lille
Member(s) of the relevant unity for the animation : Sylvie Huet

Web site : http://math.univ-lille1.fr/~celisse/SMPGD/

This workshop aims at gathering statisticians, computer scientists, and biologists to discuss new statistical methodologies for the analysis of high throughput biological data and the challenge arising herein.


StatMathAppli 2015 :
Statistic Mathematic and Applications (August 31 to September 5 2015) Fréjus
Member(s) of the relevant unity for the animation : Sylvie huet

Web site : https://colloque.inra.fr/statmathappli

Two short courses given by Ery Arias-Castro (San Diego) and Emmanuel Candes (Stanford University)


BioNLP-ST :
Workshop BioNLP Shared Task (12-13 August 2016) Berlin, Humbolt University
Member(s) of the relevant unity for the animation : Bibliome team

Web site : http://2016.bionlp-st.org

BioNLP-ST workshop is a joint event with BioASQ. Both are shared task on information extraction from texts in the biomedical domain. The workshop is a joint event with the ACL 2016 conference. This year's theme by INRA: Bacteria Biotopes and Seed Development.

Réseau(x) ou collectif(s) de recherche


D2K :
De la Donnée à la Connaissance (2015-2017)
Web site : https://digicosme.lri.fr/tiki-index.php?page=GT%20D2K

Groupe de travail du Labex DigiCosme

Réunion bimensuelle

Sur le thème de la "Résolution de questions complexes suivant un point de vue guidé par la tâche, combinaison de méthodes interdisciplinaires allant du traitement des données et de l’information à celui de la connaissance". Exemples de sujets traités :  "Modélisation et Processus", "Connaissances et Analyse d'images", "Connaissances et Raisonnement", "Analyse de contenus multimedia", "Compétitions en text-mining dans le domaine biomédical"

Contacts : Chantal Reynaud (LRI), Claire Nédellec (MaIAGE)



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by Dr. Radut